La mayoría de los cánceres de pene son carcinomas epidermoides; generalmente aparecen en hombres no circuncidados, en especial con mala higiene local.
El cáncer de pene es raro, con alrededor de 2200 casos y 460 muertes en los Estados Unidos y tasas más altas en regiones como América del Sur. El papilomavirus humano (HPV), en especial los tipos 16 y 18, tiene un papel en la etiología. Otros factores de riesgo incluyen balanitis, falta de circuncisión, infecciones de transmisión sexual (en particular HIV/sida y HPV), mala higiene y consumo de tabaco. Las lesiones premalignas incluyen la eritroplasia de Queyrat, la enfermedad de Bowen y la papulosis bowenoide. La eritroplasia de Queyrat (que afecta al glande o al interior del prepucio) y la enfermedad de Bowen (que afecta el cuerpo del pene) progresan a un carcinoma epidermoide invasor en el 5 a 10% de los pacientes; la papulosis bowenoide no parece hacerlo. Las 3 lesiones tienen manifestaciones clínicas y efectos biológicos diferentes, pero histológicamente son casi iguales; puede llamárselas más apropiadamente neoplasia intraepitelial o carcinoma in situ.